广州贯善生物科技有限公司

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[供应]微生物多样性检测
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  • 产品产地:广东广州
  • 产品品牌:贯善生物
  • 包装规格:SATXAM2016
  • 产品数量:1000000
  • 计量单位:个
  • 产品单价:600
  • 更新日期:2016-06-13 08:54:01
  • 有效期至:2017-06-13
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微生物多样性检测 详细信息

16S/18S/ITS 测序

 

    16S/18S/ITS rDNA,序列包含可变区(Variable region)和保守区(constant region)。可变区序列因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关,通过提取环境样品的DNA,并扩增和检测其中的一段或几段区域,可以了解环境样品中细菌的分类和丰度。

 

    一、技术流程

    二、生物信息分析内容

        1. 测序质量分析与统计、评估

        2. OTU列表生成及注释(默认相似度0.97)

        3. 稀释曲线、Alpha多样性分析(默认相似度0.97)

        4. 物种丰度差异分析

        5. 聚类热图

        6. 单样品、多样品物种分布

        7. OTU比较Venn图

        8. 含进化关系的物种分布

        9. Beta多样性分析

 

    三、结果展示

        1. 数据库使用

注释数据库

网页链接

16S细菌和古菌

Greengene(greengenes.secondgenome/)

ITS

Unite(unite.ut.ee/index.phpRelease)

 

        2. 版图展示

 

        图1.1所示,多样品结果构分析放在一起对比时,观测样本间的变化;

图1.1 多样本物种分布

 

    四、样本要求

        DNA总量:〉200ng;浓度:〉20 ng/μL;260/280: 1.8~2.0

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