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[供应]宏基因组测序

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宏基因组测序详细信息

宏基因组测序

宏基因组测序对环境样本所有微生物基因组DNA进行提取和高通量测序，分析样本环境中所有微生物基因组信息。宏基因组测序解读微生物群体的多样性与丰度信息，分析微生物群体基因组及功能，也探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的功能基因。

一、技术流程

二、生物信息分析内容

1. 测序质量分析与统计、评估

2.数据库比对；

3. 物种丰度分析；

4. 功能基因注释；

5. 基因功能丰度差异分析；

6. Pathway富集分析；

7.丰度差异基因/物种聚类分析

8. PCA分析

三、结果展示

1.数据库使用

数据库

网页链接

NCBI NR

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db

KEGG Pathway

kegg.jp

2.版图展示

图1.1所示，PCA分析有效展示样本间的关系

图1.1 PCA

四、样本要求

总量：〉5 μg gDNA；浓度：〉100 ng/μL；260/280：〉1.8