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聚合物基质色谱柱在色谱法中存在两相，一相是牢固不动的，咱们把它叫做牢固相 另外一相则不竭流过牢固相，咱们把它叫做活动相。色谱法的分手原理便是操纵待分手的各类物资在两相中的分派系数、吸附本领等亲和本领的分歧来进行分手的。使用外力使含有样品的活动相(气体、液体)经由过程一牢固于柱中或平板上、与活动互相不相溶的牢固相概况。聚合物基质色谱柱当活动相中照顾的夹杂物流经牢固相时，夹杂物中的各组分与牢固相产生互相感化。因为夹杂物中各组分在性子和布局上的差别，与牢固相之间发生的感化力的巨细、强弱分歧，跟着活动相的挪动，夹杂物在两相间颠末反复屡次的分派均衡，使得各组分被牢固相保存的时间分歧，从而按必定次序由牢固相中前后流出。聚合物基质色谱柱与得当的柱后检测法子连系，完成夹杂物中各组分的分手与检测。
　　聚合物基质色谱柱的离子源、质量分析器和检测器必须在高真空状态下工作，以减少本底的干扰，避免发生不必要的离子-分子反应。所以质谱反应属于单分子分解反应。利用这个特点，我们用液质联用的软电离方式可以得到化合物的准分子离子，从而得到分子量。聚合物基质色谱柱由机械真空泵(前极低真空泵)，扩散泵或分子泵(高真空泵)组成真空机组，抽取离子源和分析器部分的真空。只有在足够高的真空下，离子才能从离子源到达接收器，真空度不够则灵敏度低。
　　聚合物基质色谱柱是操纵物资的沸点、极性及吸附性子的差别来完成夹杂物的分手，其进程如图气相阐发流程图所示。待阐发样品在汽化室汽化后被惰性气体(即载气，也叫活动相)带入聚合物基质色谱柱，柱内含有液体或固体活动相，因为样品中各组分的沸点、极性或吸附机能分歧，每种组分都偏向于在活动相和牢固相之间构成分派或吸附均衡。但因为载气是活动的，这类均衡实际上很难创建起来。也恰是因为载气的活动，使样品组分在活动中进行反复屡次的分派或吸附/解吸附，聚合物基质色谱柱结果是在载气中浓度大的组分先流超卓谱柱，而在牢固相平分配浓度大的组分后流出。当组分流超卓谱柱后，当即进入检测器。检测器能够将样品组分的与否变化为电旌旗灯号，而电旌旗灯号的巨细与被测组分的量或浓度成反比。当将这些旌旗灯号放大并记实上去时，便是气相色谱图了。
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